El programa declara dos líneas de investigación, dentro de las cuales sus académicos desarrollan su investigación:
1) Telecomunicaciones y procesamiento de señales. Línea que abarca temáticas relacionadas con el tratamiento y la transmisión de la información. Comprende tanto investigación básica como aplicada, en la que se persigue crear nuevos conocimientos o aprender y aplicar aquellos ya consolidados con el propósito de participar en el desarrollo teórico y tecnológico de esta área, y de fortalecer la actividad docente de pregrado y postgrado relacionada.
2) Automatización, control y sistemas de energía eléctrica. Esta línea comprende el diseño y estudio de estrategias de control con aplicaciones a la automatización de procesos, en la búsqueda de maximizar los estándares de productividad y seguridad, minimizar los costos, entre otros objetivos, así como también, comprende la línea de investigación en torno a los sistemas de energía, como podría ser electrónica de potencia, aplicaciones de control en sistemas de generación, mercados eléctricos, etc.